[tests] Rework PyRAT tests.

tests/simple.t → tests/pyrat.t

 Test verify
-  $ cat - > bin/alt-ergo << EOF
-  > #!/bin/sh
-  > echo "2.4.0"
-  > EOF
-
-  $ chmod u+x bin/alt-ergo bin/pyrat.py bin/Marabou bin/saver
-
-  $ bin/alt-ergo
-  2.4.0
+  $ chmod u+x bin/pyrat.py
 
   $ bin/pyrat.py --version
   PyRAT 1.1
 
-  $ bin/Marabou --version
-  1.0.+
-
-  $ bin/saver --version
-  v1.0
-
   $ PATH=$(pwd)/bin:$PATH
 
   $ caisar verify -L . --format whyml --prover=PyRAT - 2>&1 <<EOF | ./filter_tmpdir.sh

tests/simple_onnx.t → tests/pyrat_onnx.t

 Test verify
-  $ cat - > bin/alt-ergo << EOF
-  > #!/bin/sh
-  > echo "2.4.0"
-  > EOF
-
-  $ chmod u+x bin/alt-ergo bin/pyrat.py bin/Marabou
-
-  $ bin/alt-ergo
-  2.4.0
+  $ chmod u+x bin/pyrat.py
 
   $ bin/pyrat.py --version
   PyRAT 1.1
 
-  $ bin/Marabou --version
-  1.0.+
-
   $ PATH=$(pwd)/bin:$PATH
 
   $ caisar verify -L . --format whyml --prover=PyRAT - 2>&1 <<EOF | ./filter_tmpdir.sh